Iso-metkatinono užterštumas gali atsirasti sintetinant metkatinoną ar susijusius junginius, pavyzdžiui, 4-MMC (mefedroną) ir 4-CMC (mefedrono analogus). Izometkatinonas yra struktūrinis metkatinono izomeras, pasižymintis panašiu psichoaktyviu poveikiu, tačiau mažiau pageidaujamas dėl mažesnio stiprumo ir didesnio šalutinio poveikio.
Viena iš izo-metkatinono užterštumo priežasčių yra nešvarių arba nekokybiškų pradinių medžiagų naudojimas. Kita galima priežastis - netinkamos reakcijos sąlygos, pavyzdžiui, per didelis karštis arba per ilgas reakcijos laikas, dėl kurių gali vykti izomerizacijos reakcijos.
Norint išvengti izo-metkatinono užteršimo sintezės metu, būtina naudoti aukštos kokybės pradines medžiagas ir atidžiai kontroliuoti reakcijos sąlygas. Tai gali apimti analitinių metodų, tokių kaip TLC ar HPLC, naudojimą, siekiant stebėti reakcijos eigą ir užtikrinti, kad būtų gaunamas pageidaujamas produktas.
Jei izo-metkatinonas užteršiamas, yra keletas būdų, kaip jį pašalinti iš galutinio produkto. Vienas iš būdų - išgryninti produktą naudojant chromatografiją, kuria galima atskirti izomerus pagal skirtingas jų fizikines ir chemines savybes. Kitas būdas - rekristalizacija, kai produktas ištirpinamas tirpiklyje, o po to lėtai atvėsinamas ir susidaro kristalai, kurie gali atskirti izomerus pagal jų skirtingą tirpumą.