Metkatinona vai radniecīgu savienojumu, piemēram, 4-MMC (mefedrona) un 4-CMC (mefedrona analogu), sintēzes laikā var rasties piesārņojums ar izometkatinonu. Izometkatinons ir metkatinona strukturālais izomērs, kam ir līdzīga psihoaktīvā iedarbība, bet kas ir mazāk vēlams zemākas iedarbības un biežāku blakusparādību dēļ.
Viens no izometkatinona piesārņojuma iemesliem ir neprecīzu vai nekvalitatīvu izejvielu izmantošana. Vēl viens iespējamais iemesls ir neatbilstošu reakcijas apstākļu izmantošana, piemēram, pārmērīga karstuma izmantošana vai pārāk ilgs reakcijas laiks, kas var izraisīt izomerizācijas reakcijas.
Lai sintēzes laikā izvairītos no izometkatinona piesārņojuma, ir svarīgi izmantot augstas kvalitātes izejvielas un rūpīgi kontrolēt reakcijas apstākļus. Tas var ietvert analītisko metožu, piemēram, TLC vai HPLC, izmantošanu, lai uzraudzītu reakcijas norisi un nodrošinātu, ka tiek iegūts vēlamais produkts.
Ja rodas izometkatinona piesārņojums, ir vairāki veidi, kā to no gala produkta novērst. Viena no metodēm ir produkta attīrīšana, izmantojot hromatogrāfiju, kas var nošķirt izomērus, pamatojoties uz to atšķirīgajām fizikālajām un ķīmiskajām īpašībām. Cita metode ir pārkristalizācija, kas ietver produkta izšķīdināšanu šķīdinātājā, pēc tam ļaujot tam lēni atdzist un veidot kristālus, kas var nošķirt izomērus, pamatojoties uz to atšķirīgo šķīdību.