Gan protonitazols, gan fentanils ir spēcīgi sintētiskie opioīdi, taču tie atšķiras pēc ķīmiskās struktūras, iedarbības un, iespējams, iedarbības. Fentanils pieder fenilpiperidīna opioīdu klasei. Tā ķīmisko struktūru raksturo piperidīna gredzens, kas savienots ar fenilgrupu. Protonitazols ir benzimidazolu opioīdu klases pārstāvis. Tā struktūra ietver benzimidazola gredzenu, kas atšķiras no fentanila fenilpiperidīna struktūras.
Fentanils ir aptuveni 50 līdz 100 reižu spēcīgāks par morfīnu. Šī lielā iedarbība veicina tā efektivitāti sāpju remdēšanā, bet arī pārdozēšanas risku. Tiek ziņots, ka protonitazēns ir vēl spēcīgāks par fentanilu. Agrīni pētījumi un neoficiāli ziņojumi liecina, ka tas varētu būt vairākas reizes spēcīgāks, taču precīzi salīdzinājumi var atšķirties.
Gan fentanils, gan protonitazēns ir spēcīgi pretsāpju līdzekļi, jo tie iedarbojas uz mu-opioīdu receptoriem smadzenēs. Abas zāles var izraisīt eiforiju, kas veicina to ļaunprātīgas lietošanas potenciālu. Eiforijas intensitāte var būt līdzīga, lai gan individuālā pieredze var atšķirties. Lielākas iedarbības dēļ protonitazēns var izraisīt spēcīgāku vai straujāku eiforiju. Abi opioīdi ievērojami nomāc elpošanas funkciju, kas ir galvenais letālas pārdozēšanas riska faktors. Protonitazēna lielāka iedarbība palielina šo risku.
Fentanila iedarbības sākums ir ātrs un iedarbības ilgums īss. Protonitazēna farmakokinētiskais profils ir sliktāk dokumentēts, taču tā iedarbības stipruma dēļ tam var būt līdzīga vai pat ātrāka sākšanās un potenciāli ilgāks ilgums.
Lai gan protonitazēnam un fentanilam ir daudz līdzību, protonitazēns ir potenciāli spēcīgāks un tādējādi rada lielāku pārdozēšanas risku. To atšķirīgā ķīmiskā struktūra nozīmē arī to, ka tiem var būt nedaudz atšķirīgi farmakoloģiskie profili un blakusparādību profili.